Theo đại diện VKS, bị cáo Đinh La Thăng đã chỉ đạo cấp dưới ký hợp đồng trái quy định, nhằm mục đích để Trịnh Xuân Thanh rút tiền tạm ứng chi tiêu sai mục đích. Chỉ trong vòng chưa đầy 10 ngày, thông qua việc chi tạm ứng, PVC đã rút tiền của PVN tạm ứng, chi sai mục đích 1.115 tỷ, gây thiệt hại hơn 119 tỷ đồng.

Ông Đinh La Thăng không thừa nhận cáo buộc, cho rằng trách nhiệm là thuộc cấp dưới, chỉ thừa nhận trách nhiệm của người đứng đầu, nhưng chưa kiểm tra, giám sát thường xuyên công việc... Ông Thăng không thừa nhận những sai phạm bị cáo buộc mà chỉ nhận trách nhiệm người đứng đầu, và sau này mới biết hợp đồng 33 là sai. Tuy nhiên, căn cứ vào tài liệu thu thập được, biên bản họp và lời khai của bị cáo, có thể khẳng định hành vi phạm tội của ông Thăng. 
Ngoài việc quyết định sử dụng 1.115 tỷ đồng trong số tiền tạm ứng này vào mục đích khác, không đưa vào Dự án Nhà máy Nhiệt điện Thái Bình 2, gây thiệt hại cho Nhà nước hơn 119 tỷ đồng, bị cáo Trịnh Xuân Thanh còn đề ra chủ trương, cùng Vũ Đức Thuận chỉ đạo Nguyễn Anh Minh và Lương Văn Hòa lập khống hồ sơ, rút hơn 13 tỷ đồng từ Ban điều hành dự án Vũng Áng - Quảng Trạch để chia nhau sử dụng cá nhân, trong đó Trịnh Xuân Thanh được ăn chia 4 tỷ đồng.
“Căn cứ vào các tài liệu đã thu thập được, căn cứ vào lời khai của các bị cáo, lời khai của nhân chứng, người liên quan, và các bằng chứng khác có trong hồ sơ vụ án, đủ cơ sở kết luận: dù bị cáo Trịnh Xuân Thanh không thừa nhận hành vi, nhưng dựa vào lời khai của các bị cáo khác, lời khai của nhân chứng, các tài liệu chứng cứ khác, có đủ cơ sở khẳng định hành vi phạm tội của bị cáo - đại diện VKS cũng khẳng định, việc truy tố các bị cáo là đúng người, đúng tội.
Cũng theo đại diện VKS, VKS áp dụng BLHS 2015 theo nguyên tắc có lợi cho người phạm tội. Hành vi tham ô của các bị cáo được áp dụng theo BLHS 2015, có hiệu lực thi hành từ ngày 1/1/2018. Xét tính chất vụ án, nhận thấy vụ án xảy ra tại PVN và PVC là vụ án đặc biệt nghiêm trọng, được dư luận quan tâm.
Các bị cáo chủ yếu là người những giữ vị trí chủ chốt trong những đơn vị kinh tế quan trọng, được Nhà nước và nhân dân tin tưởng giao quản lý vốn và thực hiện những dự án, công trình lớn của quốc gia trong đó có Dự án NMNĐ Thái Bình 2 nhưng vì những động cơ khác nhau, bao trùm lên đó là lợi ích nhóm, lợi ích cục bộ, gây nhiều hệ lụy nghiêm trọng khác.
Theo đó, VKS đề nghị mức án đối với các bị cáo như sau:
Nhóm bị cáo phạm tội cố ý làm trái:
1. Đinh La Thăng (SN 1960, nguyên Chủ tịch HĐTV Tập đoàn Dầu khí quốc gia Việt Nam (PVN): 14- 15 năm tù.
2.Trịnh Xuân Thanh (SN 1966, nguyên Chủ tịch HĐQT, Tổng giám đốc, Tổng công ty Xây lắp Dầu khí Việt Nam (PVC): 13- 14 năm tội Cố ý làm trái; tù chung thân tội Tham ô tài sản.
3. Phùng Đình Thực (SN 1954, nguyên Tổng giám đốc PVN): 12- 13 năm.
4. Nguyễn Quốc Khánh (1960, nguyên Phó tổng giám đốc PVN): 10-11 năm.
5. Nguyễn Xuân Sơn (1962, nguyên Phó tổng giám đốc PVN): 10- 11 năm.
6. Vũ Đức Thuận (1971, nguyên Tổng giám đốc PVC: 8- 9 năm tù tội Cố ý làm trái; 18-19 tội Tham ô tài sản.
7. Ninh Văn Quỳnh (SN 1958, nguyên Kế toán trưởng, kiêm Trưởng Ban tài chính kế toán và Kiểm toán PVN): 10 -11 năm.
8. Lê Đình Mậu (SN 1972, nguyên Phó Trưởng Ban Kế toán và Kiểm toán PVN: 7-8 năm.
9. Vũ Hồng Chương (1953, nguyên Trưởng Ban quản lý Dự án điện lực Dầu khí Thái Bình 2): 2-3 năm tù treo, thử thách 4-5 năm.
10. Trần Văn Nguyên (1979, nguyên Kế toán trưởng Ban Quản lý Dự án Điện lực dầu khí Thái Bình 2): 2-3 năm tù treo, thử thách 4-5 năm.
11. Nguyễn Ngọc Quý (1953, nguyên Phó chủ tịch HĐQT PVC): 8-9 năm.
12. Nguyễn Mạnh Tiến (1966, nguyên Phó tổng giám đốc PVC): 7-8 năm.
13. Phạm Tiến Đạt (1979, nguyên Kế toán trưởng PVC): 6-7 năm.
14. Trương Quốc Dũng (SN 1982, nguyên Phó Tổng giám đốc PVC): 17-18 tháng tù.
Nhóm bị cáo phạm tội tham ô:
15. Nguyễn Anh Minh (1977, nguyên Phó Tổng PVC): 18-19 năm
16. Bùi Mạnh Hiển (1976, nguyên Chánh Văn phòng PVC): 13-14 năm.
17. Lương Văn Hòa (1980, nguyên Giám đốc Ban điều hành Dự án Vũng Áng - Quảng Trạch thuộc Tổng công ty cổ phần Xây lắp dầu khí Việt Nam (PVC): 13-14 năm.
18. Nguyễn Thành Quỳnh (1973, nguyên Giám đốc Kỹ thuật Công nghệ, Tổng Công ty CP Miền Trung - Công ty Cổ phần- Đà Nẵng): 8-9 năm.
19. Lê Thị Anh Hoa (1979, nguyên Giám đốc Công ty TNHH MTV Quỳnh Hoa): 30- 36 tháng tù treo, thử thách 5 năm.
20. Nguyễn Đức Hưng (1983, nguyên Trưởng phòng Tài chính kế toán, Ban điều hành Vũng Áng - Quảng Trạch): 30- 36 tháng tù treo, thử thách 5 năm.
21. Lê Xuân Khánh (1976, nguyên Trưởng phòng kinh tế Kế hoạch, Ban điều hành Dự án Vũng Áng - Quảng Trạch): 30- 36 tháng tù treo, thử thách 5 năm.
22. Nguyễn Lý Hải (1964, nguyên Trưởng phòng kỹ thuật, Ban điều hành Dự án Vũng Áng - Quảng Trạch): 30-36 tháng tù treo, thử thách 5 năm.
XUÂN ÂN - LÊ DƯƠNG